Позиция ведомства высказана в письме от 10.07.2019.
Когда сотрудник использует личный транспорт вместо служебного, работодатель может компенсировать ему эти расходы. Если такая выплата зафиксирована в каком-нибудь локальном нормативном акте, то её можно учитывать при расчёте базы по налогу на прибыль в составе расходов на оплату труда.
Это будет корректным несмотря на то, что такая компенсация прямо не поименована в налоговом законодательстве, как уменьшающая налогооблагаемую прибыль. Но перечень выплат, которые учитываются при расчёте налога не является закрытым. Поэтому организация вправе включать в него все выплаты в пользу работников, но только в том случае, если такие компенсации предусмотрены трудовым кодексом или установлены в соответствии с нормативным актом фирмы.